Проблема учета ПООП пока что не коснулась организаций высшего образования, так как для них нет утвержденных ПООП. Однако ФГОС 3++ содержат ссылки на ПООП, и, когда последние появятся, есть риск, что они будут использоваться таким же образом.
Для организаций среднего профессионального образования такие программы уже существуют. Проблемы неоднозначности в толковании «учета ПООП» для СПО во многом аналогичны проблемам общего образования за тем исключением, что количество ПООП СПО намного больше (около 60), и оно будет продолжать расти по мере разработки и утверждения новых программ. Более того, во многих из них содержится достаточно подробное описание содержания отдельных дисциплин. При этом типичным требованием ФГОС СПО является учет ПООП по соответствующей специальности при определении содержания, объема и порядка реализации дисциплин (модулей). Если учет рассматривать как ознакомление с примером, то проблем для образовательной организации не возникает. Однако если считать, что между программами должно быть определенное соответствие, то неясно, какая степень соответствия требуется, как решать вопросы актуализации программы в зависимости от меняющихся условий и развития самой профессии. Представители организаций СПО
указывают, что, по их мнению, не во всех ПООП содержание отдельных дисциплин сформулировано корректно.